More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0327 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  634    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  98.38 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 327 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 321 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  52 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 300 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.14 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  38.14 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  35.07 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.99 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 310 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 303 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  35.82 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  34.74 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  35.42 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 299 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.64 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  36.27 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0025  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3868  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4501  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0910  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1962  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0250  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1590  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.274379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1981  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>