More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3958 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  98.32 
 
 		 299 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  80.81 
 
 		 310 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  80.47 
 
 		 300 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  79.46 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  79.46 
 
 		 300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  78.86 
 
 		 303 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  76.85 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  77.52 
 
 		 303 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  75.68 
 
 		 302 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  77.03 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  73.4 
 
 		 306 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  74.66 
 
 		 302 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  70.71 
 
 		 298 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  71.78 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 306 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 300 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 301 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  67.91 
 
 		 310 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 		 322 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 299 aa  338  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 303 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  60.61 
 
 		 315 aa  325  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  57.91 
 
 		 305 aa  319  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  54.92 
 
 		 300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 307 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  48.16 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 296 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 301 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  46.49 
 
 		 312 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  46.69 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  46.62 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  46.6 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.64 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.4 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  40.4 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  44.15 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  48.99 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  45.67 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  41.95 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 295 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.61 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  41.47 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  44.07 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  42.42 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  42.91 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  41.75 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 295 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 297 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>