More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0798 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  607  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  73.56 
 
 		 305 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  52.05 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 314 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  46.94 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 300 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.94 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  45.68 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  47.96 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  43.05 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 297 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  42.95 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  43.3 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  46.26 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  46.26 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.78 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  41.78 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 302 aa  244  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 298 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 298 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 296 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.34 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 295 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  43.54 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  46.67 
 
 		 311 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  45.8 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  40.48 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>