More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4358 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 310 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 310 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  52.23 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 305 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 301 aa  291  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  54.23 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  51.36 
 
 		 298 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  46.64 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  47.44 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 298 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 297 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 295 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 301 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 297 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.52 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  44.52 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  43.3 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 296 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.18 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  42.56 
 
 		 300 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  44.41 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  43.6 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  45.11 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 296 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 298 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.6 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  41.84 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  42.56 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  43.55 
 
 		 298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  42.31 
 
 		 301 aa  235  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  43.73 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  43.21 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 297 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  45.33 
 
 		 297 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>