More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1902 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  82.39 
 
 		 301 aa  500  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  48.98 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 300 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  46.26 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  40.34 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 296 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.28 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  38.28 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  42.81 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  39.39 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.68 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 322 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1231  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 300 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 304 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 306 aa  199  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4225  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.795038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1353  carbonate dehydratase  37.71 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199721  normal  0.335496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1553  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  37.96 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>