More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3351 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 		 297 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 302 aa  256  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 291 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  46.46 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  44.25 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  45.05 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  48.08 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 302 aa  241  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  44.22 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01306  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.82 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.387264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01316  hypothetical protein  40.82 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1793  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 299 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.73 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  48.78 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  41.61 
 
 		 297 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 299 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  44.01 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 307 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  47.74 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 311 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  43.55 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6790  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  41.72 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  42.18 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.07 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  40.07 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  43.53 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6827  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1349  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>