More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1929 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.82 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  43.96 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 		 297 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 303 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  44.41 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  41.84 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  41.5 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  39.46 
 
 		 300 aa  221  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  40.41 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  39.8 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  39.12 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1793  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1360  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6469  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0548858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  42.91 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 296 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 312 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 299 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01306  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.62 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.387264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01316  hypothetical protein  38.62 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  40.57 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6790  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35490  LysR family transcriptional regulator protein  37.58 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5478  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4886  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5384  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  39.8 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 312 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  36.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>