More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3302 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.11 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  44.11 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  44.11 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 302 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 300 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  40.86 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.52 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 310 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 310 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  40.34 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  40.61 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  39.5 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0025  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 298 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  37.15 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  38.23 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  40.49 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  39.74 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  38.35 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  38.01 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  38.36 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2455  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  35.49 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 299 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0476  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>