More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0775 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0775  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  618  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2066  transcriptional regulator, LysR family  80.6 
 
 		 300 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3210  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3171  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.01 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3362  transcriptional regulator, LysR family  38.29 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 304 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  32.19 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3288  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  32.86 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  35.09 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 303 aa  171  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1168  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1349  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  31.4 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2586  carbonate dehydratase  33.22 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3868  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  35.29 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 299 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4501  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4844  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>