More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4501 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3868  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4501  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5802  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 		 300 aa  593  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1349  LysR family transcriptional regulator  94.02 
 
 		 320 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1150  LysR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1590  LysR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.274379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1981  LysR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2389  LysR family transcriptional regulator  74.25 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1962  LysR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0910  LysR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0250  LysR family transcriptional regulator  73.42 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2124  LysR family transcriptional regulator  73.09 
 
 		 773 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0441945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47080  putative transcriptional regulator  62.96 
 
 		 302 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4062  putative transcriptional regulator  61.62 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0716  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  35.47 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  37.95 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 302 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4884  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000596604  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2118  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  34.81 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  36.49 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 298 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0080  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 		 303 aa  179  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 300 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1637  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 298 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1614  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>