More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4062 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4062  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  597  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47080  putative transcriptional regulator  91.72 
 
 		 302 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881505 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1150  LysR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0910  LysR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2389  LysR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.110916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1962  LysR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0250  LysR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.172775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1590  LysR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.274379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1981  LysR family transcriptional regulator  67.12 
 
 		 306 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2124  LysR family transcriptional regulator  66.44 
 
 		 773 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0441945  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1349  LysR family transcriptional regulator  61.95 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3868  LysR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4501  LysR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5802  LysR family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1897  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 301 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1277  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7340  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532831  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1902  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0156  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497114  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0148  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  35.71 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 324 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 329 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  35.47 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5667  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.561137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25870  LysR family transcriptional regulator protein  36.18 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  33.11 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0212  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986643  normal  0.756698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  34.81 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7268  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4884  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000596604  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>