113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52330 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  74.75 
 
 		 882 aa  1326    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  76.44 
 
 		 911 aa  1420    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  73.78 
 
 		 911 aa  1371    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  43.82 
 
 		 930 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  64.01 
 
 		 912 aa  1173    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  44.82 
 
 		 894 aa  741    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  54.69 
 
 		 893 aa  970    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 923 aa  1901    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  41.59 
 
 		 896 aa  615  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3324  type III restriction enzyme, res subunit  42.62 
 
 		 272 aa  188  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  31.11 
 
 		 840 aa  177  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  27.63 
 
 		 832 aa  114  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 977 aa  98.2  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  24.43 
 
 		 890 aa  95.5  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  25.74 
 
 		 905 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  26.97 
 
 		 873 aa  87.8  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  25.84 
 
 		 893 aa  82.8  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  25.41 
 
 		 908 aa  81.3  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  25.41 
 
 		 908 aa  81.3  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  24.22 
 
 		 893 aa  80.9  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  26.89 
 
 		 902 aa  70.1  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0304  type III restriction protein res subunit  24.1 
 
 		 890 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  22.95 
 
 		 892 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  22.93 
 
 		 899 aa  61.2  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3087  type III restriction protein res subunit  23.95 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0675  Type III restriction enzyme, res subunit  22.42 
 
 		 898 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.564365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 		 877 aa  59.7  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2739  hypothetical protein  24.11 
 
 		 881 aa  58.9  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  25.91 
 
 		 1010 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  28.95 
 
 		 998 aa  57.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  34.34 
 
 		 891 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2573  hypothetical protein  24.23 
 
 		 906 aa  56.6  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  39.24 
 
 		 1001 aa  56.2  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  25.22 
 
 		 1149 aa  55.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  32.32 
 
 		 891 aa  55.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  32.35 
 
 		 994 aa  55.5  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  34.58 
 
 		 889 aa  55.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 877 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 893 aa  55.1  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0868  type III restriction enzyme, res subunit  22.98 
 
 		 864 aa  54.7  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  36.11 
 
 		 1054 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  24.26 
 
 		 979 aa  54.3  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6679  hypothetical protein  22.51 
 
 		 881 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000129559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 1032 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  25.85 
 
 		 1053 aa  53.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  24.38 
 
 		 588 aa  52  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  33 
 
 		 997 aa  52  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  33.75 
 
 		 1008 aa  51.6  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  25.7 
 
 		 949 aa  50.8  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  27.97 
 
 		 1021 aa  50.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  23.32 
 
 		 510 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1076 aa  50.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  30.86 
 
 		 1018 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  33.01 
 
 		 1008 aa  49.7  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  33.01 
 
 		 1008 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  22.62 
 
 		 885 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.223386 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  33.01 
 
 		 1008 aa  49.7  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  33.71 
 
 		 998 aa  49.7  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  24.05 
 
 		 947 aa  49.7  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  22.01 
 
 		 579 aa  48.9  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  22.48 
 
 		 585 aa  48.9  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  22.48 
 
 		 586 aa  49.3  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 993 aa  48.9  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  21.65 
 
 		 536 aa  48.9  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  31.87 
 
 		 992 aa  48.5  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  23.81 
 
 		 848 aa  48.5  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  32.22 
 
 		 991 aa  48.5  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  29.87 
 
 		 982 aa  48.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  21.88 
 
 		 586 aa  48.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  24.9 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.47 
 
 		 558 aa  48.1  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  32.04 
 
 		 1011 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  37.5 
 
 		 991 aa  47.8  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  24.61 
 
 		 938 aa  47.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  32.04 
 
 		 1008 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  32.04 
 
 		 1008 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  32.04 
 
 		 1004 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  22.27 
 
 		 1017 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0732  type III restriction-modification enzyme  23.47 
 
 		 853 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  31.91 
 
 		 1009 aa  47  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  31.91 
 
 		 1009 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  31.87 
 
 		 1009 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  31.91 
 
 		 1009 aa  47  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  26.04 
 
 		 1020 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  31.91 
 
 		 1009 aa  47  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  31.91 
 
 		 1009 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  31.91 
 
 		 1009 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  31.91 
 
 		 1009 aa  47  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  21.92 
 
 		 586 aa  46.6  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  43.48 
 
 		 858 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.52 
 
 		 586 aa  46.6  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2101  hypothetical protein  22.45 
 
 		 864 aa  46.6  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  33.71 
 
 		 1001 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 887 aa  47  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  23.41 
 
 		 815 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  23.85 
 
 		 1051 aa  45.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 		 1033 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  27.35 
 
 		 1019 aa  45.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  22.92 
 
 		 1170 aa  45.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>