31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0732 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0732  type III restriction-modification enzyme  100 
 
 		 853 aa  1683    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0347  type III restriction protein res subunit  34.43 
 
 		 865 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1457  type III restriction protein res subunit  42.96 
 
 		 454 aa  344  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0747485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2573  hypothetical protein  37.57 
 
 		 906 aa  284  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  23.65 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  23.5 
 
 		 894 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  27.06 
 
 		 896 aa  67.8  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  25.34 
 
 		 930 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  32.04 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  18.27 
 
 		 873 aa  57.4  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  23.79 
 
 		 893 aa  53.9  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  30.67 
 
 		 845 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 1017 aa  50.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  23.53 
 
 		 923 aa  50.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  22.06 
 
 		 536 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  25.87 
 
 		 761 aa  49.7  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  26.09 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.22 
 
 		 1080 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  22.61 
 
 		 882 aa  48.5  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2726  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.52 
 
 		 1041 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  21.76 
 
 		 905 aa  48.5  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  22.2 
 
 		 911 aa  48.5  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  21.18 
 
 		 890 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  24.78 
 
 		 469 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  23.22 
 
 		 771 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  24.79 
 
 		 1099 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.07 
 
 		 489 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.07 
 
 		 489 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  23.13 
 
 		 809 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  26.78 
 
 		 974 aa  44.3  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>