21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2573 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2573  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1861    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0347  type III restriction protein res subunit  32.24 
 
 		 865 aa  345  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0732  type III restriction-modification enzyme  37.57 
 
 		 853 aa  280  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1457  type III restriction protein res subunit  38.57 
 
 		 454 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0747485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  24.35 
 
 		 840 aa  63.9  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  24.57 
 
 		 893 aa  63.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  23.27 
 
 		 930 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  24.22 
 
 		 912 aa  60.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.75 
 
 		 1169 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  24.23 
 
 		 923 aa  56.6  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  25.88 
 
 		 1170 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  27.06 
 
 		 894 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.55 
 
 		 1169 aa  49.3  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  24.89 
 
 		 896 aa  48.9  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  38.46 
 
 		 1082 aa  48.5  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.36 
 
 		 1068 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  21.97 
 
 		 1113 aa  46.2  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.29 
 
 		 1068 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  25.68 
 
 		 911 aa  45.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  21.32 
 
 		 873 aa  44.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  26.67 
 
 		 787 aa  44.3  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>