23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0347 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0347  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 865 aa  1752    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1457  type III restriction protein res subunit  46.86 
 
 		 454 aa  383  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0747485 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0732  type III restriction-modification enzyme  34.73 
 
 		 853 aa  358  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2573  hypothetical protein  32.24 
 
 		 906 aa  345  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.69 
 
 		 1126 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  21.62 
 
 		 840 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  22.8 
 
 		 912 aa  54.7  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  26.06 
 
 		 1174 aa  52.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23.67 
 
 		 1124 aa  52.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  34.69 
 
 		 893 aa  51.2  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.48 
 
 		 1167 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  22.86 
 
 		 882 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  40.35 
 
 		 989 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.45 
 
 		 1169 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  24.43 
 
 		 938 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 1137 aa  46.2  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  37.33 
 
 		 911 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  37.33 
 
 		 911 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  41.27 
 
 		 930 aa  45.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0129  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 846 aa  44.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.042937  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  29.59 
 
 		 845 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  25.15 
 
 		 1188 aa  44.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  34.94 
 
 		 1169 aa  44.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>