108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3655 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  83.64 
 
 
882 aa  1502    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  89.1 
 
 
911 aa  1675    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  100 
 
 
911 aa  1871    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  45.71 
 
 
930 aa  734    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  65.29 
 
 
912 aa  1211    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  45.72 
 
 
894 aa  758    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  55.57 
 
 
893 aa  993    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  73.78 
 
 
923 aa  1371    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  40.32 
 
 
896 aa  625  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3324  type III restriction enzyme, res subunit  46.41 
 
 
272 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  30.23 
 
 
840 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  26.38 
 
 
832 aa  111  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 
977 aa  107  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 
890 aa  91.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  25.77 
 
 
905 aa  91.3  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  25.22 
 
 
893 aa  84.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  27.56 
 
 
873 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  25.35 
 
 
908 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  25.35 
 
 
908 aa  82  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  23.91 
 
 
893 aa  79.7  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  23.21 
 
 
938 aa  71.2  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  26.51 
 
 
899 aa  62  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2739  hypothetical protein  25.31 
 
 
881 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  31.58 
 
 
998 aa  60.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0304  type III restriction protein res subunit  24.1 
 
 
890 aa  59.3  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  36.49 
 
 
1032 aa  57.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  22.62 
 
 
889 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  31.82 
 
 
1001 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  26.39 
 
 
902 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3087  type III restriction protein res subunit  31.86 
 
 
835 aa  56.2  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  35.06 
 
 
891 aa  55.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0675  Type III restriction enzyme, res subunit  25.33 
 
 
898 aa  55.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.564365 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  23.15 
 
 
1054 aa  55.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 
877 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  22.47 
 
 
892 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  33.73 
 
 
891 aa  55.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  31.3 
 
 
1009 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  31.3 
 
 
1009 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  31.3 
 
 
1009 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  31.3 
 
 
1009 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  31.3 
 
 
1009 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  31.3 
 
 
1009 aa  53.9  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  31.3 
 
 
1009 aa  53.9  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  33.33 
 
 
994 aa  53.9  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 
1018 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  33.67 
 
 
1010 aa  53.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  24.47 
 
 
1149 aa  53.5  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 
877 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  31.54 
 
 
1008 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  31.54 
 
 
1008 aa  52.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  34.09 
 
 
1008 aa  52.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  29.84 
 
 
997 aa  52.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  31.54 
 
 
1008 aa  52  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  29.32 
 
 
991 aa  52  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  24.89 
 
 
979 aa  51.6  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  31.3 
 
 
993 aa  51.2  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  32.32 
 
 
1008 aa  51.2  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  30.53 
 
 
1009 aa  51.2  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  25.62 
 
 
588 aa  51.2  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  33.77 
 
 
1076 aa  51.2  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 
992 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  23.54 
 
 
619 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  31.58 
 
 
1008 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  23.48 
 
 
885 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.223386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  32.32 
 
 
1011 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  33.71 
 
 
998 aa  50.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  32.8 
 
 
1001 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  32.32 
 
 
1004 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  25 
 
 
1053 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  21.86 
 
 
616 aa  48.9  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  28.23 
 
 
1077 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  22.28 
 
 
858 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0868  type III restriction enzyme, res subunit  23.14 
 
 
864 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  40 
 
 
1060 aa  48.5  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  21.63 
 
 
536 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  22.58 
 
 
510 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  37.5 
 
 
991 aa  48.1  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1457  type III restriction protein res subunit  26.14 
 
 
454 aa  48.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0747485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  34.92 
 
 
982 aa  47.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  32.94 
 
 
984 aa  47.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 
1010 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  21.65 
 
 
848 aa  47.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  28.97 
 
 
1021 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  22.73 
 
 
590 aa  47  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  31.58 
 
 
909 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  21.18 
 
 
583 aa  47  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  22.92 
 
 
558 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  30.3 
 
 
991 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  26.09 
 
 
949 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  26.32 
 
 
980 aa  46.6  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  28.28 
 
 
1018 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 
590 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 
946 aa  45.4  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  32.5 
 
 
887 aa  45.8  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0347  type III restriction protein res subunit  37.33 
 
 
865 aa  45.8  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  23.55 
 
 
560 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  33.73 
 
 
989 aa  45.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  30.08 
 
 
1019 aa  45.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  24.92 
 
 
787 aa  44.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  35.63 
 
 
989 aa  44.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>