17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1297 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  100 
 
 
1017 aa  2032    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  39.91 
 
 
1104 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  36.55 
 
 
1070 aa  622  1e-176  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  37.19 
 
 
1048 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  36.97 
 
 
1062 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  36.97 
 
 
1062 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.49 
 
 
1036 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 
1104 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  34.94 
 
 
1096 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  35.06 
 
 
1135 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  34.98 
 
 
1126 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  34.45 
 
 
1099 aa  502  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0412  hypothetical protein  34.9 
 
 
643 aa  309  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.613055  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  26.87 
 
 
974 aa  103  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0501  type III restriction protein res subunit  26.95 
 
 
989 aa  102  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  26.37 
 
 
947 aa  97.4  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0732  type III restriction-modification enzyme  23.64 
 
 
853 aa  48.9  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>