19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0399 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 		 1104 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  39.77 
 
 		 1070 aa  667    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  39.75 
 
 		 1017 aa  709    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0412  hypothetical protein  88.59 
 
 		 643 aa  1063    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.613055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1104 aa  2268    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  37.13 
 
 		 1048 aa  621  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  35.64 
 
 		 1062 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  35.64 
 
 		 1062 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  35.25 
 
 		 1099 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.67 
 
 		 1036 aa  556  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1126 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  35.73 
 
 		 1096 aa  538  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1135 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  24.25 
 
 		 947 aa  117  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0501  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 989 aa  97.8  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  22.63 
 
 		 974 aa  91.7  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2408  type III restriction enzyme, res subunit  25.22 
 
 		 907 aa  48.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3852  type III restriction enzyme, res subunit  25.21 
 
 		 803 aa  47.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.345387  normal  0.793201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3779  type III restriction enzyme, res subunit  25.21 
 
 		 803 aa  47.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>