18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0501 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  74.22 
 
 		 974 aa  1434    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0501  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 989 aa  1971    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  29.61 
 
 		 947 aa  316  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1126 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1096 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  25.57 
 
 		 1048 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1135 aa  111  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.14 
 
 		 1104 aa  111  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  24.08 
 
 		 1062 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  24.08 
 
 		 1062 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 		 1099 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 1104 aa  97.8  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  26.87 
 
 		 1017 aa  95.9  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.89 
 
 		 1036 aa  91.3  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  23.06 
 
 		 1070 aa  89.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3559  hypothetical protein  38.58 
 
 		 145 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0839707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 787 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  27.1 
 
 		 1233 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>