19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1682 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  100 
 
 		 947 aa  1882    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0501  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 		 989 aa  316  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  29.18 
 
 		 974 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.23 
 
 		 1036 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.65 
 
 		 1104 aa  121  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  24.25 
 
 		 1104 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 1048 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1096 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  26.23 
 
 		 1099 aa  112  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  25.08 
 
 		 1070 aa  110  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  26.37 
 
 		 1017 aa  90.1  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1135 aa  87.8  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1126 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0412  hypothetical protein  38.67 
 
 		 643 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.613055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  24.05 
 
 		 923 aa  49.7  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3559  hypothetical protein  32.48 
 
 		 145 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0839707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  24.27 
 
 		 911 aa  47  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  32.17 
 
 		 1062 aa  45.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  32.17 
 
 		 1062 aa  45.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>