20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1692 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 974 aa  1925    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0501  type III restriction protein res subunit  74.22 
 
 		 989 aa  1458    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  29.25 
 
 		 947 aa  319  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  26.87 
 
 		 1048 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1096 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  26.6 
 
 		 1062 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  26.6 
 
 		 1062 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.27 
 
 		 1104 aa  109  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 		 1099 aa  108  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  26.3 
 
 		 1070 aa  106  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1126 aa  103  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  27.96 
 
 		 1017 aa  99  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 		 1104 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1135 aa  93.2  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.31 
 
 		 1036 aa  82.8  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3559  hypothetical protein  37.3 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0839707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  27.55 
 
 		 787 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  27.74 
 
 		 1130 aa  46.2  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  27.47 
 
 		 1113 aa  45.4  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 1233 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>