17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1479 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1070 aa  2212    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  39.7 
 
 		 1104 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  36.27 
 
 		 1017 aa  616  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  35.84 
 
 		 1062 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  35.84 
 
 		 1062 aa  579  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 		 1104 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  35.32 
 
 		 1048 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  33.99 
 
 		 1099 aa  496  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1126 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1096 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1135 aa  439  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.36 
 
 		 1036 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0412  hypothetical protein  37.68 
 
 		 643 aa  307  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.613055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  25.08 
 
 		 947 aa  110  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  26.39 
 
 		 974 aa  98.2  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0501  type III restriction protein res subunit  23.06 
 
 		 989 aa  89.7  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1385  hypothetical protein  34 
 
 		 102 aa  55.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.542228  normal  0.308153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>