14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0412 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  88.59 
 
 		 1104 aa  1062    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0412  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1320    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.613055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  37.68 
 
 		 1070 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  34.9 
 
 		 1017 aa  297  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.66 
 
 		 1104 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  35.42 
 
 		 1048 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  33.16 
 
 		 1099 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  31.33 
 
 		 1062 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  31.33 
 
 		 1062 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1126 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1096 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1135 aa  236  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 		 1036 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  40.98 
 
 		 947 aa  55.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>