16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4905 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1542  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.31 
 
 		 1104 aa  715    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0594  hypothetical protein  67.54 
 
 		 1096 aa  1512    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4905  hypothetical protein  100 
 
 		 1126 aa  2313    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.511478  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0960  hypothetical protein  62.57 
 
 		 1135 aa  1425    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2067  type III restriction protein res subunit  40.74 
 
 		 1048 aa  764    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0707  type III restriction protein res subunit  35.11 
 
 		 1099 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0399  type III restriction protein res subunit  35.28 
 
 		 1104 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303076 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1297  type III restriction protein res subunit  35.07 
 
 		 1017 aa  528  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0063  type III restriction protein res subunit  33.62 
 
 		 1062 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1839  type III restriction protein res subunit  33.62 
 
 		 1062 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1479  type III restriction enzyme, res subunit  31.96 
 
 		 1070 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.980213  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.15 
 
 		 1036 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0412  hypothetical protein  34.4 
 
 		 643 aa  249  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.613055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0501  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 		 989 aa  117  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1692  type III restriction enzyme, res subunit  25.13 
 
 		 974 aa  95.5  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.181928  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1682  putative type III restriction enzyme R protein  24.39 
 
 		 947 aa  83.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00043962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>