26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2855 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  78.04 
 
 		 1025 aa  1652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  71.54 
 
 		 1014 aa  1491    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1018 aa  2112    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  84.84 
 
 		 1021 aa  1803    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  73.38 
 
 		 1020 aa  1541    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  73.33 
 
 		 1018 aa  1540    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  53.3 
 
 		 999 aa  1034    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  36.33 
 
 		 1039 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  36.05 
 
 		 1039 aa  551  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  32.62 
 
 		 938 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  32.77 
 
 		 889 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  26.76 
 
 		 890 aa  100  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  26.65 
 
 		 908 aa  94.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  26.65 
 
 		 908 aa  94.7  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  24.66 
 
 		 893 aa  87.4  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  25 
 
 		 832 aa  84.3  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  24.14 
 
 		 905 aa  82.4  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  26.37 
 
 		 977 aa  79  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  24.86 
 
 		 893 aa  77.8  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  53.49 
 
 		 840 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 923 aa  48.5  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  46 
 
 		 873 aa  48.1  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  26.83 
 
 		 912 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  26.62 
 
 		 911 aa  48.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  28.08 
 
 		 893 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  28.28 
 
 		 911 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>