25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1468 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  72.1 
 
 		 1020 aa  1529    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1025 aa  2136    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  77.24 
 
 		 1021 aa  1677    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  53.04 
 
 		 999 aa  1016    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  72.85 
 
 		 1018 aa  1540    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  78.04 
 
 		 1018 aa  1672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  69.43 
 
 		 1014 aa  1454    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  37.2 
 
 		 1039 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  35.95 
 
 		 1039 aa  571  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  31.88 
 
 		 938 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  32.21 
 
 		 889 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  25.49 
 
 		 890 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  25.99 
 
 		 893 aa  94.4  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  26.2 
 
 		 832 aa  92.8  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  24.34 
 
 		 905 aa  88.6  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  26.72 
 
 		 908 aa  86.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  26.68 
 
 		 977 aa  85.9  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  26.72 
 
 		 908 aa  86.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  24.38 
 
 		 893 aa  82.8  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  23.19 
 
 		 896 aa  53.5  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  23.49 
 
 		 912 aa  50.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  55.81 
 
 		 840 aa  51.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  46 
 
 		 873 aa  49.3  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 894 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6679  hypothetical protein  21.94 
 
 		 881 aa  44.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000129559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>