38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0435 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 977 aa  2004    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  26.81 
 
 		 832 aa  220  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  26.39 
 
 		 908 aa  191  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 908 aa  191  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  26.28 
 
 		 905 aa  190  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  26.34 
 
 		 890 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  25.45 
 
 		 893 aa  174  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  25.47 
 
 		 893 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  27.09 
 
 		 938 aa  127  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1350  type III restriction-modification enzyme, helicase subunit  41.25 
 
 		 188 aa  125  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  26.46 
 
 		 882 aa  112  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  26.33 
 
 		 889 aa  108  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  25.63 
 
 		 911 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  26.53 
 
 		 911 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 912 aa  101  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  30.62 
 
 		 923 aa  98.2  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  28.96 
 
 		 893 aa  95.5  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  26.45 
 
 		 1039 aa  93.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  27.15 
 
 		 930 aa  91.3  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  27.98 
 
 		 1039 aa  89.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  26.91 
 
 		 896 aa  88.2  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  27.57 
 
 		 894 aa  88.2  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 1025 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  26.5 
 
 		 1018 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  25.37 
 
 		 1014 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  27.52 
 
 		 1021 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  27.6 
 
 		 1020 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  26.37 
 
 		 1018 aa  79  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  26.98 
 
 		 999 aa  68.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  25.54 
 
 		 840 aa  56.2  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  28.09 
 
 		 873 aa  52  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  31.62 
 
 		 1169 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  29.91 
 
 		 1137 aa  47  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  29.06 
 
 		 1170 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1670  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  31.62 
 
 		 1169 aa  47  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  36.11 
 
 		 787 aa  46.2  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6679  hypothetical protein  32.81 
 
 		 881 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000129559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  24.14 
 
 		 760 aa  44.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>