21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2421 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  77.64 
 
 		 1039 aa  1693    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1039 aa  2164    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  36.98 
 
 		 1018 aa  605  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  36.62 
 
 		 1020 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  37.43 
 
 		 1021 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  35.67 
 
 		 1025 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  36.93 
 
 		 1014 aa  562  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  36.05 
 
 		 1018 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  37.51 
 
 		 999 aa  552  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  30.78 
 
 		 938 aa  356  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  30.02 
 
 		 889 aa  323  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  29.54 
 
 		 890 aa  126  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  27.63 
 
 		 905 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  26.65 
 
 		 908 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  26.65 
 
 		 908 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  26.88 
 
 		 893 aa  107  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  26.68 
 
 		 893 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  26.16 
 
 		 977 aa  90.9  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  23.45 
 
 		 832 aa  79.3  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  58.14 
 
 		 840 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  39.19 
 
 		 873 aa  47.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>