25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0242 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1014 aa  2098    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  71.64 
 
 		 1018 aa  1517    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  69.43 
 
 		 1025 aa  1454    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  68.05 
 
 		 1020 aa  1420    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  72.38 
 
 		 1021 aa  1534    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  67.55 
 
 		 1018 aa  1413    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  54.8 
 
 		 999 aa  1059    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  37.12 
 
 		 1039 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  36.89 
 
 		 1039 aa  556  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  32.98 
 
 		 938 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  32.69 
 
 		 889 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  23.06 
 
 		 893 aa  120  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  29.14 
 
 		 890 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  27.56 
 
 		 908 aa  102  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  27.56 
 
 		 908 aa  102  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  26.65 
 
 		 905 aa  101  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  26.01 
 
 		 893 aa  95.1  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  28.06 
 
 		 832 aa  95.1  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  25.37 
 
 		 977 aa  81.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  23.03 
 
 		 896 aa  52.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  53.49 
 
 		 840 aa  50.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  23.3 
 
 		 912 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  48 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  26.26 
 
 		 893 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  26.86 
 
 		 930 aa  44.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>