49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1044 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  57.52 
 
 		 908 aa  1073    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  57.52 
 
 		 908 aa  1073    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  57.52 
 
 		 905 aa  1102    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  57.16 
 
 		 890 aa  1098    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  73.09 
 
 		 893 aa  1410    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 893 aa  1846    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  33.18 
 
 		 832 aa  415  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  25.67 
 
 		 977 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  23.49 
 
 		 938 aa  129  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  24.16 
 
 		 889 aa  114  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  26.92 
 
 		 1039 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  26.88 
 
 		 1039 aa  107  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 896 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  26.74 
 
 		 999 aa  101  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  24.44 
 
 		 930 aa  98.2  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  25.61 
 
 		 1021 aa  96.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  25.05 
 
 		 911 aa  95.1  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  26.01 
 
 		 1014 aa  94.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  23.41 
 
 		 894 aa  94.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  24.95 
 
 		 882 aa  92.8  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  25.6 
 
 		 1018 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 1025 aa  92.8  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  24.22 
 
 		 923 aa  91.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  26.23 
 
 		 893 aa  91.3  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  23.91 
 
 		 911 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  23.96 
 
 		 912 aa  88.6  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  24.66 
 
 		 1018 aa  87.4  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  23.35 
 
 		 1020 aa  82.8  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  32.64 
 
 		 840 aa  77  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  27.84 
 
 		 998 aa  54.3  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6679  hypothetical protein  22.48 
 
 		 881 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000129559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  49.06 
 
 		 873 aa  50.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  25.83 
 
 		 584 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  25.67 
 
 		 584 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  37.08 
 
 		 994 aa  48.9  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  25.29 
 
 		 584 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  30.43 
 
 		 991 aa  48.5  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  25.67 
 
 		 584 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  36.14 
 
 		 989 aa  47.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  32.43 
 
 		 1001 aa  46.6  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  27.78 
 
 		 997 aa  47  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  35.96 
 
 		 998 aa  47  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 993 aa  46.2  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  27.74 
 
 		 1001 aa  45.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1076 aa  45.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  28.22 
 
 		 1010 aa  44.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  31.15 
 
 		 1011 aa  44.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  31.15 
 
 		 1004 aa  44.3  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  31.15 
 
 		 1008 aa  44.3  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>