19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6679 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6679  hypothetical protein  100 
 
 		 881 aa  1822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000129559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  24.95 
 
 		 890 aa  68.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  23.66 
 
 		 905 aa  60.1  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  21.83 
 
 		 896 aa  59.3  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  22.2 
 
 		 908 aa  57.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  22.2 
 
 		 908 aa  57.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  22.51 
 
 		 923 aa  55.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  21.64 
 
 		 894 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  20.74 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  23.67 
 
 		 977 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  26.03 
 
 		 873 aa  51.6  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  21.83 
 
 		 911 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  21.74 
 
 		 882 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  22.48 
 
 		 893 aa  50.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  27.17 
 
 		 840 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  21.22 
 
 		 1025 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  20.96 
 
 		 893 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 		 1039 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  23.33 
 
 		 1113 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>