23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4690 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  54.47 
 
 		 1014 aa  1062    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  53.3 
 
 		 1018 aa  1047    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  53.04 
 
 		 1025 aa  1011    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  55 
 
 		 1020 aa  1061    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  53.69 
 
 		 1021 aa  1035    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  54.78 
 
 		 1018 aa  1053    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 999 aa  2052    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  37.52 
 
 		 1039 aa  572  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  37.74 
 
 		 1039 aa  558  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  35.36 
 
 		 938 aa  432  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  34.51 
 
 		 889 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  29.67 
 
 		 890 aa  117  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  28.61 
 
 		 905 aa  110  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  27.45 
 
 		 832 aa  102  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  26.74 
 
 		 893 aa  101  7e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  27.22 
 
 		 908 aa  99.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  27.22 
 
 		 908 aa  99.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 893 aa  94.4  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  27.25 
 
 		 977 aa  68.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  58.14 
 
 		 840 aa  51.6  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  48 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  33.78 
 
 		 930 aa  44.7  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  46.51 
 
 		 896 aa  44.7  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>