24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0934 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1039 aa  2154    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  77.64 
 
 		 1039 aa  1667    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  37.91 
 
 		 1018 aa  610  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  37.42 
 
 		 1020 aa  594  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  37.73 
 
 		 1021 aa  592  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  36.33 
 
 		 1018 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  37.01 
 
 		 1025 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  37.15 
 
 		 999 aa  562  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  36.87 
 
 		 1014 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  30.57 
 
 		 938 aa  346  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  29.68 
 
 		 889 aa  318  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  29.03 
 
 		 905 aa  122  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  29.44 
 
 		 890 aa  122  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  26.56 
 
 		 908 aa  121  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  26.56 
 
 		 908 aa  121  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  27.01 
 
 		 893 aa  108  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  26.92 
 
 		 893 aa  108  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  26.82 
 
 		 832 aa  97.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 977 aa  93.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  57.78 
 
 		 840 aa  51.6  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  54 
 
 		 873 aa  52  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  35.21 
 
 		 894 aa  45.8  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  24.43 
 
 		 930 aa  45.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  48.84 
 
 		 896 aa  45.4  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>