25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2946 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1468  type III restriction protein res subunit  72.85 
 
 		 1025 aa  1517    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.780281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0199  type III restriction enzyme, res subunit  75.47 
 
 		 1021 aa  1598    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4690  type III restriction protein res subunit  54.78 
 
 		 999 aa  1040    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553282  normal  0.43699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0242  Type III restriction enzyme, res subunit  67.55 
 
 		 1014 aa  1398    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2855  type III restriction enzyme, res subunit  73.33 
 
 		 1018 aa  1540    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2946  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1018 aa  2109    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4168  type III restriction enzyme, res subunit  70.63 
 
 		 1020 aa  1476    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0263776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0934  type III restriction enzyme, res subunit  37.91 
 
 		 1039 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2421  type III restriction protein res subunit  36.98 
 
 		 1039 aa  595  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0551  hypothetical protein  32.91 
 
 		 889 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.830331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4078  hypothetical protein  31.5 
 
 		 938 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.862006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0549  type III restriction protein res subunit  27.88 
 
 		 890 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0198  hypothetical protein  23.73 
 
 		 832 aa  104  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1044  type III restriction enzyme, res subunit  25.6 
 
 		 893 aa  92.4  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2792  type III restriction protein res subunit  26.48 
 
 		 908 aa  92  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3191  type III restriction-modification system, Res subunit  26.48 
 
 		 908 aa  92  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1492  type III restriction-modification enzyme helicase subunit  25.4 
 
 		 905 aa  85.9  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0435  type III restriction protein res subunit  26.5 
 
 		 977 aa  84.7  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137797  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5437  type III restriction protein res subunit  24 
 
 		 893 aa  77.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.463119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  60.47 
 
 		 840 aa  54.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  50 
 
 		 873 aa  52.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  29.13 
 
 		 912 aa  48.9  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  30.08 
 
 		 893 aa  47.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  51.16 
 
 		 896 aa  47.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  25.54 
 
 		 1170 aa  45.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>