21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2101 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2101  hypothetical protein  100 
 
 		 864 aa  1769    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1261  type III restriction enzyme, res subunit  56.62 
 
 		 861 aa  957    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.392356  normal  0.0808521 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4044  type III restriction protein res subunit  33.11 
 
 		 867 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.856779 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3329  type III restriction enzyme, res subunit  42.28 
 
 		 243 aa  185  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1418  type III restriction protein res subunit  24.04 
 
 		 751 aa  82.4  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5300  type III restriction enzyme, res subunit family  22.48 
 
 		 729 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1462  superfamily II DNA/RNA helicase  22.35 
 
 		 736 aa  59.3  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  35.14 
 
 		 885 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.223386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2739  hypothetical protein  35.14 
 
 		 881 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  23.93 
 
 		 877 aa  52.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  45.61 
 
 		 899 aa  52  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0884  hypothetical protein  22.94 
 
 		 840 aa  50.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  36.73 
 
 		 892 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  37.5 
 
 		 858 aa  47.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0675  Type III restriction enzyme, res subunit  41.67 
 
 		 898 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.564365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  22.45 
 
 		 923 aa  46.6  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3087  type III restriction protein res subunit  36.73 
 
 		 835 aa  46.6  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  29.76 
 
 		 902 aa  45.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  32.84 
 
 		 998 aa  45.4  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  32.79 
 
 		 994 aa  44.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0304  type III restriction protein res subunit  38.78 
 
 		 890 aa  44.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>