38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3087 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013207  Aaci_3087  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 835 aa  1717    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2739  hypothetical protein  40.36 
 
 		 881 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  38.04 
 
 		 885 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.223386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  34.19 
 
 		 892 aa  290  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  32.93 
 
 		 902 aa  255  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  32.29 
 
 		 899 aa  224  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0868  type III restriction enzyme, res subunit  32.16 
 
 		 864 aa  224  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  35.34 
 
 		 858 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0675  Type III restriction enzyme, res subunit  30.56 
 
 		 898 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.564365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0304  type III restriction protein res subunit  29.24 
 
 		 890 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  31.38 
 
 		 877 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1418  type III restriction protein res subunit  25.1 
 
 		 751 aa  67.4  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  23.36 
 
 		 930 aa  64.3  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  21.35 
 
 		 894 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4002  hypothetical protein  24.15 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  25.77 
 
 		 912 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5300  type III restriction enzyme, res subunit family  26.28 
 
 		 729 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  23.26 
 
 		 893 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  23.95 
 
 		 923 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  22.51 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  22.9 
 
 		 911 aa  56.2  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  24.33 
 
 		 882 aa  56.2  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  31.86 
 
 		 911 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1462  superfamily II DNA/RNA helicase  26.97 
 
 		 736 aa  55.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  25.4 
 
 		 840 aa  54.3  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  26.07 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4044  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 867 aa  53.5  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.856779 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4078  type III restriction enzyme, res subunit  26.54 
 
 		 913 aa  48.5  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.778545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1261  type III restriction enzyme, res subunit  38.78 
 
 		 861 aa  48.5  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.392356  normal  0.0808521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 1032 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0533  type III restriction enzyme, res subunit family  27 
 
 		 825 aa  46.6  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.100371  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2101  hypothetical protein  36.73 
 
 		 864 aa  46.6  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  37.93 
 
 		 1001 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4239  type III restriction enzyme, res subunit  24.91 
 
 		 907 aa  46.6  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  29.2 
 
 		 998 aa  45.8  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  26.42 
 
 		 891 aa  46.2  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 1008 aa  44.7  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  38.46 
 
 		 1054 aa  44.7  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>