77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0579 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  59.64 
 
 		 877 aa  1066    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0566  Type III site-specific deoxyribonuclease  95.29 
 
 		 891 aa  1725    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0796023 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0579  Type III site-specific deoxyribonuclease  100 
 
 		 891 aa  1813    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.193547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  48.31 
 
 		 887 aa  830    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  53.72 
 
 		 982 aa  611  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2180  Type III site-specific deoxyribonuclease  54.08 
 
 		 984 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  51.63 
 
 		 991 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0365  type III restriction protein res subunit  51.24 
 
 		 978 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000898416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  49.76 
 
 		 989 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  48.15 
 
 		 993 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0790  type III restriction enzyme, res subunit  46.34 
 
 		 992 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186387 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0042  type III restriction-modification system, res subunit  45.92 
 
 		 1009 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  46.19 
 
 		 998 aa  499  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  42.14 
 
 		 1001 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  45.54 
 
 		 990 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  45.28 
 
 		 1009 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0260  type III restriction system endonuclease  45.28 
 
 		 1009 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2927  Type III restriction enzyme, res subunit  45.18 
 
 		 1010 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00341327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0047  Type III restriction enzyme, res subunit  45.28 
 
 		 1009 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  46.59 
 
 		 997 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2673  type III restriction-modification system, res subunit  45.12 
 
 		 1009 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1846  type III restriction-modification system, res subunit  45.12 
 
 		 1009 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2706  Type III restriction enzyme, res subunit  45.12 
 
 		 1009 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3281  type III restriction-modification system, res subunit  45.12 
 
 		 1009 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  46.15 
 
 		 991 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0028  type III restriction protein res subunit  44.46 
 
 		 1008 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0027  type III restriction enzyme, res subunit  44.94 
 
 		 1008 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0046  type III restriction protein res subunit  44.78 
 
 		 1008 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0019  type III restriction enzyme, res subunit  44.78 
 
 		 1011 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0043  type III restriction enzyme, res subunit  44.94 
 
 		 1008 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.855331  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3212  Type III restriction enzyme, res subunit  44.94 
 
 		 1008 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.505736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  45 
 
 		 991 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  46.71 
 
 		 994 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0028  type III restriction protein res subunit  44.48 
 
 		 1004 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  43.89 
 
 		 1001 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  45.3 
 
 		 998 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1114  type III restriction-modification system, restriction endonuclease subunit  40.79 
 
 		 1019 aa  425  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.189519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5226  type III restriction protein res subunit  39.94 
 
 		 1018 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.310365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2729  restriction endonuclease  41.44 
 
 		 909 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1827  type III restriction enzyme, res subunit  42.15 
 
 		 1032 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1149  type III restriction protein res subunit  40.69 
 
 		 1024 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.511254  normal  0.0779427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2486  type III restriction enzyme, res subunit  39.84 
 
 		 1010 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252383  decreased coverage  0.0052761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3485  type III restriction enzyme, res subunit  40.45 
 
 		 1019 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340393  normal  0.439729 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  40.39 
 
 		 1009 aa  395  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0544  type III restriction enzyme, res subunit  40.1 
 
 		 1012 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0929  type III restriction protein res subunit  40 
 
 		 1060 aa  389  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2246  type III restriction enzyme, res subunit  40.72 
 
 		 1033 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.428313  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1522  type III restriction protein res subunit  41.52 
 
 		 1008 aa  379  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000221168  hitchhiker  0.00161886 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0362  type III restriction-modification system, res subunit  32.8 
 
 		 1054 aa  346  8.999999999999999e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.262363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1200  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1076 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.563874  normal  0.0639023 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1019  type III restriction-modification system enzyme, R subunit  32.06 
 
 		 987 aa  210  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0453  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  30.69 
 
 		 989 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985709  hitchhiker  1.2237e-22 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0393  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  30.86 
 
 		 989 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00360009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0390  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  30.86 
 
 		 989 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264054  hitchhiker  1.42432e-23 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0398  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  30.52 
 
 		 989 aa  202  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982266  hitchhiker  7.86285e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1463  restriction endonuclease  30.82 
 
 		 991 aa  201  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0411  type III restriction-modification system StyLTI enzyme res  30.17 
 
 		 989 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.63396  hitchhiker  0.00000141502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  38.05 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3802  type III restriction protein res subunit  27.82 
 
 		 894 aa  61.6  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0937  hypothetical protein  34.94 
 
 		 911 aa  56.6  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000206148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0344  type III restriction protein res subunit  32.58 
 
 		 893 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3325  type III restriction enzyme, res subunit  36.14 
 
 		 930 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.16803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0026  type III restriction-modification system, R subunit, putative  35.29 
 
 		 882 aa  55.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.352538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52330  Type III restriction enzyme, res subunit  32.32 
 
 		 923 aa  55.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  26.89 
 
 		 892 aa  55.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3655  Type III restriction-modification enzyme helicase subunit  33.73 
 
 		 911 aa  55.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00000324142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1979  type III restriction protein res subunit  43.33 
 
 		 896 aa  54.3  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  34.94 
 
 		 912 aa  54.3  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1086  type III restriction enzyme, res subunit  30.68 
 
 		 840 aa  53.5  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.865892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 899 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0675  Type III restriction enzyme, res subunit  41.3 
 
 		 898 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.564365 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2275  hypothetical protein  38.98 
 
 		 902 aa  48.5  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  43.75 
 
 		 858 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2739  hypothetical protein  42.59 
 
 		 881 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 877 aa  46.6  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  38.2 
 
 		 873 aa  44.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  40.38 
 
 		 885 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.223386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>