25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4044 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4044  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 867 aa  1770    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.856779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2101  hypothetical protein  33.11 
 
 		 864 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1261  type III restriction enzyme, res subunit  30.03 
 
 		 861 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.392356  normal  0.0808521 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3329  type III restriction enzyme, res subunit  28.86 
 
 		 243 aa  102  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5300  type III restriction enzyme, res subunit family  22.71 
 
 		 729 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000832274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1462  superfamily II DNA/RNA helicase  23.54 
 
 		 736 aa  78.2  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1418  type III restriction protein res subunit  23.79 
 
 		 751 aa  76.3  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2778  type III restriction enzyme, res subunit  21.41 
 
 		 885 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.223386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03954  hypothetical protein  22.85 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0675  Type III restriction enzyme, res subunit  23.46 
 
 		 898 aa  57.4  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.564365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0850  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 877 aa  54.7  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4389  type III restriction enzyme, res subunit  35.96 
 
 		 858 aa  54.7  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2739  hypothetical protein  36.23 
 
 		 881 aa  53.5  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3087  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 835 aa  53.5  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0884  hypothetical protein  22.57 
 
 		 840 aa  52.8  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4095  type III restriction enzyme, res subunit  26.21 
 
 		 899 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18343  normal  0.460419 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0533  type III restriction enzyme, res subunit family  21.51 
 
 		 825 aa  51.6  0.00006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.100371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4167  type III restriction protein res subunit  25.72 
 
 		 912 aa  47.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0973  type III restriction enzyme, res subunit family  22.74 
 
 		 892 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0304  type III restriction protein res subunit  23.31 
 
 		 890 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.67 
 
 		 504 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4239  type III restriction enzyme, res subunit  30 
 
 		 907 aa  45.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4078  type III restriction enzyme, res subunit  30 
 
 		 913 aa  45.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.778545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0868  type III restriction enzyme, res subunit  23.31 
 
 		 864 aa  44.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  22.41 
 
 		 797 aa  44.7  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>