More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0739 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0739  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
308 aa  608  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2523  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  79.55 
 
 
308 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4663  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.13 
 
 
305 aa  361  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0638635  normal  0.199282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.84 
 
 
343 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0848  amino acid ABC transporter permease  50.18 
 
 
300 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14781  ABC-type amino acid transport system, permease component  48.18 
 
 
297 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0940688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1167  amino acid ABC transporter permease  45.29 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0247  ABC-type permease for basic amino acids and glutamine  41.6 
 
 
377 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12141  ABC transporter for amino acids, membrane component  48.31 
 
 
297 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12311  ABC transporter for amino acids, membrane component  43.06 
 
 
297 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.351586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3605  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.06 
 
 
349 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0125063 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0613  amino acid ABC transporter, permease protein, 3-TM region, His/Glu/Gln/Arg/opine  48.19 
 
 
299 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0857916  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14261  amino acid ABC transporter permease  48.19 
 
 
299 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1808  amino acid ABC transporter permease  52.49 
 
 
296 aa  225  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2945  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 
332 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2087  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  71.53 
 
 
390 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283496  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  71.53 
 
 
390 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1999  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  72.18 
 
 
388 aa  199  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.584111  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003416  amino acid ABC transporter permease protein  41.67 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4004  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.92 
 
 
396 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0588648  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2559  amino acid ABC transporter permease  36.89 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658439  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.75 
 
 
392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0337  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.42 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0191604  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.71 
 
 
390 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3989  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.7 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4180  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.7 
 
 
434 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2325  amino acid ABC transporter permease  57.93 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1455  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.89 
 
 
396 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5871  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.96 
 
 
400 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470509  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7859  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.85 
 
 
403 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3586  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.39 
 
 
398 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174346  normal  0.0312139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1107  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.94 
 
 
397 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.29497  normal  0.877087 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6438  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.94 
 
 
397 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.856456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1759  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.19 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400548  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.39 
 
 
431 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1562  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.19 
 
 
400 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.360472  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0394  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.24 
 
 
420 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.108285  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1748  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, inner membrane subunit BztB  63.24 
 
 
420 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3559  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.48 
 
 
394 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.527755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03127  predicted amino-acid transporter subunit  62.22 
 
 
393 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1003  amino acid ABC transporter permease  62.22 
 
 
398 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03078  hypothetical protein  62.22 
 
 
393 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3463  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  62.22 
 
 
393 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3564  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  62.22 
 
 
393 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.982473  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0437  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.22 
 
 
393 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4588  amino acid ABC transporter, permease protein, His/Glu/Gln/Arg/opine family  62.22 
 
 
393 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3708  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.48 
 
 
393 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.223639 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0437  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  62.22 
 
 
393 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.81646  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3755  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  62.22 
 
 
393 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0635797  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3398  hypothetical protein  52.08 
 
 
378 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176645  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1073  amino acid ABC transporter permease  57.72 
 
 
393 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2552  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  57.46 
 
 
398 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1256  amino acid ABC transporter, permease protein  60 
 
 
393 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2502  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  61.76 
 
 
420 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.318532  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2556  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.26 
 
 
397 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0743  amino acid ABC transporter, permease protein  60 
 
 
397 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4394  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60 
 
 
391 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0737  amino acid ABC transporter, permease protein  60 
 
 
454 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0053  amino acid ABC transporter permease protein precursor  49.11 
 
 
371 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0974  amino acid ABC transporter, permease protein  62.96 
 
 
401 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00117291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2056  general L-amino acid ABC transporter permease protein  55.7 
 
 
373 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.191054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.21 
 
 
396 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0794  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.3 
 
 
417 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138757  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2985  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.44 
 
 
400 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.570925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02362  ABC transporter permease  59.06 
 
 
390 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2550  amino acid ABC transporter permease  63.2 
 
 
401 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288222  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.35 
 
 
233 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3702  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.72 
 
 
392 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0121  amino acid ABC transporter permease  55.03 
 
 
392 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0780  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.89 
 
 
387 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1298  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  60.74 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1528  amino acid ABC transporter, inner membrane component  56.3 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426969  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4551  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.16 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0905  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2911  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.94 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4427  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.575705  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2070  amino acid ABC transporter permease  60.8 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.380407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3924  putative amino acid transport protein, permease protein  59.06 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.96716  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0295  amino acid ABC transporter permease  61.83 
 
 
422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.934704  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1704  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.04 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.72 
 
 
392 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0974  amino acid ABC transporter permease  60 
 
 
393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.97702  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0228  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.74 
 
 
392 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2819  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  54.07 
 
 
405 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2823  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  54.07 
 
 
405 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0140632  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.38 
 
 
429 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.608852  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4429  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.28 
 
 
380 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.424364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.27 
 
 
391 aa  142  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.558305  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4214  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
247 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0319  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport system permease  61.83 
 
 
411 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  normal  0.832344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  37.5 
 
 
596 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 
237 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.709473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.56 
 
 
596 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1430  amino acid ABC transporter permease  36.65 
 
 
233 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.813328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3069  amino acid ABC transporter permease  36.91 
 
 
292 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.74 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4592  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
247 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.504039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4190  polar amino acid ABC transporter permease  38.14 
 
 
245 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.012386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>