More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3069 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3069  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
292 aa  584  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.45 
 
 
357 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0778505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0478  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.11 
 
 
293 aa  286  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.58 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.71 
 
 
249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000217  amino acid ABC transporter permease protein  45.2 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968139  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05953  ABC transporter permease protein  43.49 
 
 
306 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3958  amino acid ABC transporter permease  42.51 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0201  amino acid ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
298 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3071  amino acid ABC transporter permease  42.35 
 
 
309 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.35 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0444  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  40.77 
 
 
294 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.74 
 
 
315 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.61 
 
 
335 aa  169  7e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
320 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2686  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.88 
 
 
316 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0551964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.49 
 
 
320 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.49 
 
 
320 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.49 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.78 
 
 
271 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000547103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0815  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.13 
 
 
246 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal  0.0721562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.04 
 
 
337 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000215  amino acid ABC transporter permease protein  35.56 
 
 
265 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 
334 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05951  ABC transporter ATP-binding/permease protein  34.04 
 
 
265 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  42.06 
 
 
320 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5814  ABC transporter permease  42.06 
 
 
320 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460546  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
233 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
223 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2288  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.31 
 
 
278 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0446  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  32.33 
 
 
264 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  39.06 
 
 
319 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  41.23 
 
 
251 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
263 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
337 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.580602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
268 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  39.47 
 
 
714 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  40.87 
 
 
501 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1931  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 
261 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1386  amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
337 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0861  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.35 
 
 
263 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.820023 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0396  amino acid ABC transporter permease  42.36 
 
 
277 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0905  amino acid ABC transporter, permease protein, His/Glu/Gln/Arg/opine family  32.41 
 
 
260 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.22009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
235 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.15 
 
 
227 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
266 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0283053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.96 
 
 
268 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  35.59 
 
 
216 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0203  amino acid ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.57 
 
 
513 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.52 
 
 
493 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
216 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2650  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.9 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.24 
 
 
492 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  34.9 
 
 
596 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  35.27 
 
 
237 aa  139  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37 
 
 
216 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
217 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 
216 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3795  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 
216 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 
218 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1045  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.89 
 
 
215 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  32.48 
 
 
218 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  32.48 
 
 
218 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  32.48 
 
 
218 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0911  amino acid ABC transporter permease  33.56 
 
 
265 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.312712  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.91 
 
 
218 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.93 
 
 
224 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.5 
 
 
221 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  35.44 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0770  amino acid ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 
218 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 
218 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.23 
 
 
216 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  32.48 
 
 
218 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0709  amino acid ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0677  amino acid ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
218 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1825  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
262 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120265  normal  0.903781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0482  glutamate/aspartate transmembrane ABC transporter protein  34.51 
 
 
242 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2523  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.77 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  36.09 
 
 
219 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0458  amino acid ABC transporter permease  31.62 
 
 
242 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0358  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.73 
 
 
242 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0871077  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0373  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.73 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.25147  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  35.65 
 
 
219 aa  132  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3103  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.71 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264371  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.2 
 
 
250 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.91 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2307  amino acid ABC transporter permease  35.22 
 
 
261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000136717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3015  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.04 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0156724  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>