More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3015 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3015  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0156724  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  77.38 
 
 
222 aa  348  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  76.26 
 
 
222 aa  334  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1593  amino acid ABC transporter permease  79.64 
 
 
222 aa  327  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4411  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  78.73 
 
 
222 aa  317  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2049  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  76.92 
 
 
222 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188063  normal  0.429889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4159  amino acid ABC transporter permease  77.83 
 
 
222 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2797  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  78.73 
 
 
222 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2390  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  77.83 
 
 
222 aa  293  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.68 
 
 
233 aa  208  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.49 
 
 
235 aa  204  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  45.22 
 
 
237 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.03 
 
 
224 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.12 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
221 aa  194  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  46.89 
 
 
216 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.37 
 
 
216 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.37 
 
 
216 aa  190  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.98 
 
 
216 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  46.98 
 
 
216 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  45.45 
 
 
251 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 
220 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  45.5 
 
 
501 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.19 
 
 
223 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  43.93 
 
 
263 aa  184  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.26 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.19 
 
 
513 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.83 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.83 
 
 
226 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.12 
 
 
215 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.34 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0568  amino acid ABC transporter permease  44.04 
 
 
223 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0984  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 
339 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3276  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 
339 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  44.04 
 
 
223 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 
227 aa  175  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
334 aa  174  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0469  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
220 aa  174  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.93 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.36 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3547  amino acid ABC transproter permease protein  39.19 
 
 
222 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.443422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.23 
 
 
221 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3549  amino acid ABC transproter permease protein  39.19 
 
 
222 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.26 
 
 
219 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.324967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3699  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.92 
 
 
221 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  44.23 
 
 
230 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  44.23 
 
 
230 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3235  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
222 aa  168  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1931  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
272 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0799  amino acid ABC transporter, permease protein  42.23 
 
 
266 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3497  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
215 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.87 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3518  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 
218 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0338  amino acid ABC transport system, permease  46.57 
 
 
269 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145734  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
219 aa  165  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  42.51 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.6 
 
 
223 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  42.58 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1800  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.99477  normal  0.0316116 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.58 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1293  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
360 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0697282  normal  0.837718 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  42.51 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  42.51 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  42.51 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  42.51 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  42.51 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  42.51 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0352  amino acid ABC transproter, permease  46.08 
 
 
291 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.38 
 
 
219 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5743  putative amino acid ABC transporter permease  46.08 
 
 
269 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.76 
 
 
337 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.39 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  41.35 
 
 
223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.06 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.19 
 
 
226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
220 aa  161  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
492 aa  161  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
234 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  37.85 
 
 
235 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
232 aa  161  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  37.85 
 
 
235 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
209 aa  161  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
209 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  39.41 
 
 
209 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.19 
 
 
222 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  37.85 
 
 
226 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  37.85 
 
 
232 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.29 
 
 
320 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.29 
 
 
320 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.36 
 
 
335 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 
209 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>