More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1593 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1593  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559066  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  81.08 
 
 
222 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  76.13 
 
 
222 aa  354  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4411  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.43 
 
 
222 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2049  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  81.98 
 
 
222 aa  334  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188063  normal  0.429889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4159  amino acid ABC transporter permease  81.08 
 
 
222 aa  331  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3015  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  79.64 
 
 
221 aa  327  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0156724  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2797  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  85.14 
 
 
222 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2390  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  84.68 
 
 
222 aa  324  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.72 
 
 
233 aa  199  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.21 
 
 
224 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  41.38 
 
 
237 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.34 
 
 
216 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.98 
 
 
235 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  44.29 
 
 
216 aa  189  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.23 
 
 
216 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.75 
 
 
216 aa  187  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
221 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.52 
 
 
216 aa  184  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  44.13 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
263 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  42.92 
 
 
251 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  44.98 
 
 
501 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.31 
 
 
223 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
227 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.22 
 
 
513 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
220 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.09 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
315 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0568  amino acid ABC transporter permease  41.01 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0984  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.58 
 
 
339 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 
218 aa  171  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3276  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.58 
 
 
339 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.17 
 
 
268 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.97 
 
 
215 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
226 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  44.55 
 
 
219 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
226 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.88 
 
 
221 aa  168  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
226 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.93 
 
 
226 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3699  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.12 
 
 
221 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.83 
 
 
261 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3547  amino acid ABC transproter permease protein  39.27 
 
 
222 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.443422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3549  amino acid ABC transproter permease protein  39.27 
 
 
222 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
334 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
226 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1931  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.33 
 
 
272 aa  164  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0469  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.324967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3235  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  43.27 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.27 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  41.1 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0799  amino acid ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  39.62 
 
 
218 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  39.62 
 
 
218 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  39.62 
 
 
218 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 
230 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
226 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1800  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
224 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.99477  normal  0.0316116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3518  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
218 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  39.62 
 
 
218 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
225 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3497  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.27 
 
 
215 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
232 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  45.41 
 
 
218 aa  159  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0553  glutamine ABC transporter permease  39.62 
 
 
218 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.421713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  37.9 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.62 
 
 
230 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.04 
 
 
221 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  37.44 
 
 
219 aa  158  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 
226 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2181  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 
224 aa  158  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0554  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.21 
 
 
218 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0338  amino acid ABC transport system, permease  41.04 
 
 
269 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
320 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.89 
 
 
221 aa  158  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  40.89 
 
 
320 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1293  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.87 
 
 
360 aa  158  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0697282  normal  0.837718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.16 
 
 
221 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 
320 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0352  amino acid ABC transproter, permease  41.04 
 
 
291 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5743  putative amino acid ABC transporter permease  41.04 
 
 
269 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
232 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
234 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.25 
 
 
219 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>