More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4159 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_4159  amino acid ABC transporter permease  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  84.23 
 
 
222 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  77.48 
 
 
222 aa  354  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1593  amino acid ABC transporter permease  81.08 
 
 
222 aa  331  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559066  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2049  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  76.58 
 
 
222 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188063  normal  0.429889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4411  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  76.13 
 
 
222 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3015  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  77.83 
 
 
221 aa  308  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0156724  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2797  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  78.83 
 
 
222 aa  304  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2390  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  78.83 
 
 
222 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.58 
 
 
233 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
216 aa  185  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
224 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  42.22 
 
 
237 aa  181  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
235 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  44.44 
 
 
251 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 
216 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.04 
 
 
216 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.7 
 
 
513 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  45.05 
 
 
216 aa  177  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  45.54 
 
 
216 aa  177  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
216 aa  176  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.33 
 
 
315 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.85 
 
 
223 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.33 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.23 
 
 
321 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  40.85 
 
 
263 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  43 
 
 
501 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 
230 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
221 aa  167  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.9 
 
 
268 aa  167  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
218 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.33 
 
 
215 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0568  amino acid ABC transporter permease  40.09 
 
 
223 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 
230 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0469  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.09 
 
 
223 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.25 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3276  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.98 
 
 
339 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0984  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.98 
 
 
339 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  42.92 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0338  amino acid ABC transport system, permease  42.45 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  41.36 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
226 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
232 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
485 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
485 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0352  amino acid ABC transproter, permease  41.98 
 
 
291 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5743  putative amino acid ABC transporter permease  41.98 
 
 
269 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
337 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  41.29 
 
 
223 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.16 
 
 
221 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.8 
 
 
219 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.78 
 
 
226 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0799  amino acid ABC transporter, permease protein  41.04 
 
 
266 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 
218 aa  158  6e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
226 aa  158  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3699  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 
221 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.02 
 
 
226 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.91 
 
 
223 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.36 
 
 
226 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
219 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.324967 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
232 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.95 
 
 
492 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.73 
 
 
219 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
335 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.36 
 
 
226 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2807  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
217 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.65 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.65 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  42.65 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  42.65 
 
 
230 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.65 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.65 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1293  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
360 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0697282  normal  0.837718 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  42.65 
 
 
219 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  36.45 
 
 
234 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  36.92 
 
 
235 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
225 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  39.61 
 
 
230 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  36.92 
 
 
235 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.5 
 
 
219 aa  155  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
221 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3549  amino acid ABC transproter permease protein  35.43 
 
 
222 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3547  amino acid ABC transproter permease protein  35.43 
 
 
222 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.443422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.36 
 
 
219 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0219509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  36.45 
 
 
226 aa  154  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
225 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3409  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  43.14 
 
 
223 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  36.45 
 
 
232 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>