More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0728 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  58.72 
 
 
235 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  54.59 
 
 
237 aa  244  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.71 
 
 
233 aa  241  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.81 
 
 
216 aa  234  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  52.78 
 
 
216 aa  232  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.35 
 
 
216 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.35 
 
 
216 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.71 
 
 
224 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  51.87 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.22 
 
 
218 aa  207  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.51 
 
 
315 aa  205  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  47.85 
 
 
216 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.33 
 
 
216 aa  203  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.02 
 
 
227 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 
513 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  51.21 
 
 
501 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1071  hypothetical protein  58.56 
 
 
235 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.07 
 
 
493 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.8 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 
492 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0500  amino acid ABC transporter permease  49.26 
 
 
242 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3518  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.49 
 
 
218 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  47.26 
 
 
223 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 
334 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
320 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  48.54 
 
 
320 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
320 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0469  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.2 
 
 
220 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.54 
 
 
320 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.54 
 
 
223 aa  191  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.79 
 
 
237 aa  188  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  47.78 
 
 
263 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
223 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  45 
 
 
222 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
222 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.27 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0861  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.04 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.820023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 
222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  43.26 
 
 
222 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  48.54 
 
 
320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.22 
 
 
226 aa  181  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 
337 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  46.12 
 
 
319 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5814  ABC transporter permease  48.06 
 
 
320 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.54 
 
 
335 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2588  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
221 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
267 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.755534 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0582  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.65 
 
 
223 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0568  amino acid ABC transporter permease  40.65 
 
 
223 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
266 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0283053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.71 
 
 
337 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.580602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.93 
 
 
485 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.93 
 
 
485 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.39 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.92 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.92 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  43.4 
 
 
219 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1386  amino acid ABC transporter permease  45.26 
 
 
337 aa  171  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2056  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
255 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  44.29 
 
 
222 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 
230 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3398  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
226 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.7 
 
 
246 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
261 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
222 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
222 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
222 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1264  L-cystine ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
222 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0917804  normal  0.0118842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2152  L-cystine ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
222 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
503 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
222 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  41.26 
 
 
714 aa  169  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 
222 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  40.19 
 
 
230 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 
256 aa  168  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2505  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.59 
 
 
222 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.110474  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
219 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1931  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44 
 
 
272 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  42.92 
 
 
219 aa  168  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
222 aa  167  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  42.11 
 
 
502 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.47 
 
 
220 aa  167  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.59 
 
 
222 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  43.18 
 
 
221 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
219 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0219509  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  40 
 
 
263 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>