More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2368 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  68.75 
 
 
223 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.14 
 
 
227 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  64.86 
 
 
251 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.86 
 
 
223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.73 
 
 
237 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  51.4 
 
 
223 aa  211  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  49.3 
 
 
219 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  48.37 
 
 
219 aa  208  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  208  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  49.07 
 
 
235 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  49.07 
 
 
218 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  49.07 
 
 
235 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1707  glutamine ABC transporter permease protein  50.47 
 
 
228 aa  204  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.165583  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  48.13 
 
 
218 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
235 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
235 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
235 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
235 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
218 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
235 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1155  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
218 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.58 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1478  glutamine ABC transporter permease protein  48.84 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3698  glutamine ABC transporter permease protein  48.6 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1599  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2356  glutamine ABC transporter permease protein  48.13 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1774  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000313733  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1494  glutamine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0612957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2489  glutamine ABC transporter permease protein  49.3 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  48.34 
 
 
501 aa  194  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  44.26 
 
 
237 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.22 
 
 
221 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.41 
 
 
492 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 
493 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  44.76 
 
 
216 aa  191  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.24 
 
 
216 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1583  glutamine ABC transporter permease protein  48.37 
 
 
219 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.76 
 
 
216 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2392  glutamine ABC transporter permease protein  47.44 
 
 
219 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303951  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.4 
 
 
216 aa  185  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  44.5 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.56 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.59 
 
 
513 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  47.39 
 
 
216 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.63 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.12 
 
 
218 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.61 
 
 
233 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  44.28 
 
 
319 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  43 
 
 
222 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
222 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.19 
 
 
271 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.500436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  41.74 
 
 
222 aa  175  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.71 
 
 
503 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0354411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 
222 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 
222 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.38 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.45 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1264  L-cystine ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0917804  normal  0.0118842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.45 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3518  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.4 
 
 
218 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
337 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
320 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0861  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
263 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.820023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2152  L-cystine ABC transporter, permease protein  41.98 
 
 
222 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
263 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
320 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
261 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.28 
 
 
320 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
320 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.93 
 
 
268 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.63 
 
 
219 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37 
 
 
255 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.15 
 
 
219 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  40.67 
 
 
222 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.15 
 
 
219 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.31 
 
 
226 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  41.15 
 
 
219 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
222 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  41.15 
 
 
219 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
485 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  41.15 
 
 
219 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>