More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2596 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
271 aa  534  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000547103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3071  amino acid ABC transporter permease  62.66 
 
 
309 aa  275  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  59.2 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0446  binding-protein-dependent transport system inner membrane component  50.41 
 
 
264 aa  245  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.286473  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05951  ABC transporter ATP-binding/permease protein  49.41 
 
 
265 aa  241  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000215  amino acid ABC transporter permease protein  49.41 
 
 
265 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2288  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.34 
 
 
278 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.449306  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2686  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.33 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0551964 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0203  amino acid ABC transporter, permease protein  51.43 
 
 
265 aa  215  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286767  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3960  amino acid ABC transporter permease  48.78 
 
 
251 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.12 
 
 
334 aa  168  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.46 
 
 
315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3069  amino acid ABC transporter permease  38.78 
 
 
292 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46 
 
 
320 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  45.5 
 
 
320 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
320 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
320 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.01 
 
 
337 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.2 
 
 
337 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.580602 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0905  amino acid ABC transporter, permease protein, His/Glu/Gln/Arg/opine family  40.89 
 
 
260 aa  159  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.22009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  45 
 
 
319 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0478  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.17 
 
 
293 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.238477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5814  ABC transporter permease  48.51 
 
 
320 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
357 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0778505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.86 
 
 
335 aa  155  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  48.51 
 
 
320 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 
321 aa  154  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  42.33 
 
 
263 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.04 
 
 
233 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1931  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 
272 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000387195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.51 
 
 
261 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.2 
 
 
268 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  42.29 
 
 
219 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  42.29 
 
 
219 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  42.29 
 
 
219 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  42.29 
 
 
219 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  42.29 
 
 
219 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  42.13 
 
 
222 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  42.93 
 
 
217 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.5 
 
 
216 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
222 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.93 
 
 
295 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.5 
 
 
216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  44.5 
 
 
216 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  42.65 
 
 
263 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  41.79 
 
 
219 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  41.29 
 
 
219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0590  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0283053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0861  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.31 
 
 
263 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.820023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0911  amino acid ABC transporter permease  39.63 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.312712  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.2 
 
 
216 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.13 
 
 
216 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.2 
 
 
222 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  35.65 
 
 
235 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  35.65 
 
 
235 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3103  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
274 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2970  amino acid ABC transporter permease  42.36 
 
 
217 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1386  amino acid ABC transporter permease  44.68 
 
 
337 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693888  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  35.45 
 
 
218 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.07 
 
 
503 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  42.08 
 
 
489 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
489 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
489 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 
228 aa  142  5e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.22 
 
 
221 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 
224 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  40.3 
 
 
219 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
216 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.29 
 
 
503 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  35.45 
 
 
218 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1018  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1163  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.07294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  42.01 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0964  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.5 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000818449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
235 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
235 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  39.46 
 
 
235 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
235 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  39.46 
 
 
235 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
235 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
235 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
218 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  37.5 
 
 
218 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2999  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
281 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 
234 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  39.46 
 
 
226 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  39.46 
 
 
232 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 
209 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3757  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.73 
 
 
270 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>