More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2999 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2999  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
281 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2801  amino acid ABC transporter permease  59.32 
 
 
281 aa  298  7e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0656  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  58.46 
 
 
273 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.326275  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0690  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.73 
 
 
273 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0225851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0973  amino acid ABC transporter permease  55.11 
 
 
280 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981425  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.62 
 
 
273 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571072  normal  0.507902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1133  amino acid ABC transporter, permease protein  59.05 
 
 
243 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.17 
 
 
323 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5510  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.34 
 
 
324 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.442153  decreased coverage  0.000455607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.72 
 
 
321 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3263  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.18 
 
 
323 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.25 
 
 
246 aa  188  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  42.45 
 
 
223 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0780  amino-acid ABC transporter permease protein YckJ  41.83 
 
 
210 aa  158  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
510 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  41.33 
 
 
489 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.33 
 
 
489 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.33 
 
 
489 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
245 aa  155  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.75 
 
 
219 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_003296  RS00358  amino acid ABC transporter transmembrane protein  42.79 
 
 
262 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.8 
 
 
503 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.28 
 
 
222 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  41.67 
 
 
219 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  39.57 
 
 
222 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  40.78 
 
 
234 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1927  amino acid ABC transporter permease  42.16 
 
 
245 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2849  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42 
 
 
215 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0467618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 
503 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.18 
 
 
219 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  41.18 
 
 
219 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  41.18 
 
 
219 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  41.18 
 
 
219 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  40.45 
 
 
263 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  41.18 
 
 
219 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  41.18 
 
 
219 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 
219 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  40.69 
 
 
219 aa  148  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  37.28 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  37.28 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.72 
 
 
232 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  36.84 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.21 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  40.69 
 
 
225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.14 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
493 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.21 
 
 
225 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  40.71 
 
 
274 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.26 
 
 
219 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0330968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.26 
 
 
219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 
263 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2001  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 
335 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.11761  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  42.21 
 
 
226 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  40.1 
 
 
219 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  40.27 
 
 
230 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
243 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  40.27 
 
 
230 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  40.27 
 
 
219 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2004  amino acid ABC transporter, permease protein  35.58 
 
 
239 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  40.27 
 
 
219 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  40.27 
 
 
219 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  40.27 
 
 
219 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  40.27 
 
 
219 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  39.11 
 
 
209 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  39.7 
 
 
228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5810  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
227 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709635  normal  0.465789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0402  amino acid ABC transporter permease  40 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
219 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0294  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.55 
 
 
233 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.198172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0359  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.76 
 
 
260 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  37.62 
 
 
226 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2853  amino acid ABC transporter permease  37.89 
 
 
292 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.09 
 
 
226 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  38.61 
 
 
209 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.94 
 
 
221 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  40.3 
 
 
222 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0233  amino acid ABC transporter permease  40.5 
 
 
217 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4596  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.82 
 
 
304 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  41.87 
 
 
501 aa  143  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.05 
 
 
220 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
222 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  36.84 
 
 
222 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  38.5 
 
 
230 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.35 
 
 
222 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.35 
 
 
222 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  36.36 
 
 
222 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  36.94 
 
 
216 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2286  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 
261 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000263216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.86 
 
 
222 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5181  cystine ABC transporter, permease protein, putative  39.8 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2152  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3808  amino acid ABC transporter permease  44.2 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.158502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  37.32 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>