More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0359 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0359  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0239  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.69 
 
 
260 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0245  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  82.69 
 
 
260 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0300  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  80.38 
 
 
260 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1603  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  75.68 
 
 
260 aa  345  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0402  amino acid ABC transporter permease  64.17 
 
 
273 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_003296  RS00358  amino acid ABC transporter transmembrane protein  60.78 
 
 
262 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1061  amino acid ABC transporter permease  55.86 
 
 
263 aa  228  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.958726  normal  0.719789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 
220 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  45.36 
 
 
228 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
223 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  43.3 
 
 
222 aa  158  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
227 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.54 
 
 
216 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  41.47 
 
 
237 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3744  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  48.33 
 
 
219 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.06 
 
 
216 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  43.78 
 
 
216 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3475  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.78 
 
 
219 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646385  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0972  amino acid ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
219 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000627476  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4263  amino acid ABC transporter, permease protein  42.29 
 
 
219 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00620505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  38.97 
 
 
251 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.71 
 
 
226 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0294  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
233 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.198172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4058  amino acid ABC transporter permease  41.79 
 
 
219 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3897  amino acid ABC transporter, permease  41.79 
 
 
219 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.09435e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3904  amino acid ABC transporter, permease  41.79 
 
 
219 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000728027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4375  amino acid ABC transporter permease  41.79 
 
 
219 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000115102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4173  amino acid ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
219 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.126592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.2 
 
 
216 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
221 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.2 
 
 
216 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4224  amino acid ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
219 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000683545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
268 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.94 
 
 
216 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4284  amino acid ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
219 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000456924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.84 
 
 
224 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
221 aa  149  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
233 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
503 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.93 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.39 
 
 
221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.18 
 
 
218 aa  146  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.01 
 
 
235 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
250 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3405  amino acid ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 
263 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.679621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 
226 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0376  amino acid ABC transporter permease  42.42 
 
 
319 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.55 
 
 
226 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.12 
 
 
221 aa  145  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.52 
 
 
320 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2999  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
281 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.3 
 
 
219 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0219509  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3994  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.3 
 
 
219 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0526601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3699  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.67 
 
 
221 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0315  putative ABC transporter permease protein  40.39 
 
 
213 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000179875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.98 
 
 
221 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5023  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  43.14 
 
 
320 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0963279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4897  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 
320 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0442  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 
320 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
492 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1819  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 
334 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  43.63 
 
 
501 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  39.7 
 
 
219 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
337 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2491  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3013  amino acid ABC transporter permease  39.82 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2074  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.49 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3398  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.7 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670046  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3761  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000810372  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  39.22 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
222 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0208  amino acid ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 
218 aa  140  3e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.84 
 
 
226 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600792  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 
510 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.41 
 
 
223 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.324967 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  43.28 
 
 
501 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
217 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5814  ABC transporter permease  43.43 
 
 
320 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
513 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.73 
 
 
225 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
227 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  38.5 
 
 
727 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6678  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.29 
 
 
241 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 
217 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67040  ABC transporter permease  43.94 
 
 
320 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.19 
 
 
230 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  37.62 
 
 
219 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5810  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
227 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.709635  normal  0.465789 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 
485 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.95 
 
 
485 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3836  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
226 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3393  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.53 
 
 
226 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0664089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0576  ABC-type amino acid transport system, permease component  39.79 
 
 
213 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.307016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>