More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5480 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
219 aa  430  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  79.81 
 
 
223 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0835  amino acid ABC transporter inner membrane protein  75.23 
 
 
219 aa  322  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1548  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  75.23 
 
 
219 aa  321  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3057  polar amino acid ABC transporter permease  74.3 
 
 
219 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3092  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  74.3 
 
 
219 aa  317  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3004  polar amino acid ABC transporter permease  74.3 
 
 
219 aa  317  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2004  polar amino acid ABC transporter permease  73.83 
 
 
219 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.695709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2610  polar amino acid ABC transporter permease  73.83 
 
 
219 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.703731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2135  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  73.83 
 
 
219 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0776  polar amino acid ABC transporter permease  73.83 
 
 
219 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.77 
 
 
219 aa  297  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0330968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4773  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  74.77 
 
 
219 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2587  amino acid ABC transporter permease  69.16 
 
 
234 aa  294  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2513  amino acid ABC transporter, permease protein  69.05 
 
 
274 aa  288  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.152618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  68.22 
 
 
219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  67.29 
 
 
219 aa  287  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1807  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  69.52 
 
 
219 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0766  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  69.52 
 
 
219 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0399907  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0396  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  69.52 
 
 
230 aa  286  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.310385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1738  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  69.52 
 
 
219 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.094824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1255  amino acid ABC transporter, permease protein  69.52 
 
 
219 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1976  amino acid ABC transporter, permease protein  69.52 
 
 
230 aa  286  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1823  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  69.52 
 
 
219 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1680  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  66.22 
 
 
230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0758513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4694  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  65.33 
 
 
230 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.586539  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1528  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.33 
 
 
230 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.85059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1453  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.78 
 
 
259 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  65.78 
 
 
259 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1552  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  64.89 
 
 
230 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0406  ABC transporter permease  65.84 
 
 
230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3132  amino acid ABC transporter permease  60.66 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1072  amino acid ABC transporter permease  75.76 
 
 
240 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  63.81 
 
 
230 aa  244  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04080  putative permease of ABC transporter  63.81 
 
 
230 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2114  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  47.66 
 
 
222 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000270288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2167  L-cystine transport system permease TcyB  47.2 
 
 
222 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0765863  hitchhiker  0.00000339309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2505  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.66 
 
 
222 aa  204  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.110474  normal  0.780737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1168  amino acid ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease protein  47.2 
 
 
222 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.066667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2108  amino acid ABC transporter His/Glu/Gln/Arg/opine family, permease  47.2 
 
 
222 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0113123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2692  L-cystine ABC transporter, permease protein  46.73 
 
 
222 aa  202  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0324102  normal  0.0361809 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.73 
 
 
222 aa  202  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000424447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1721  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.73 
 
 
222 aa  202  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2017  L-cystine ABC transporter, permease protein  46.73 
 
 
222 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2152  L-cystine ABC transporter, permease protein  46.73 
 
 
222 aa  202  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1264  L-cystine ABC transporter, permease protein  46.73 
 
 
222 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0917804  normal  0.0118842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1291  His/Glu/Gln/Arg/opine family amino acid ABC transporter permease  46.73 
 
 
222 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1046  L-cystine ABC transporter, permease protein  46.26 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0095554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2935  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0211  amino acid ABC transporter, permease  44.8 
 
 
238 aa  195  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.17 
 
 
217 aa  193  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
234 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
209 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5181  cystine ABC transporter, permease protein, putative  48.58 
 
 
222 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  44.5 
 
 
235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  44.5 
 
 
232 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  44.5 
 
 
235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
209 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
209 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  44.5 
 
 
226 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2032  amino acid ABC transporter permease  45.75 
 
 
220 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  44.81 
 
 
222 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
209 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.29 
 
 
232 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.81 
 
 
222 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.88 
 
 
232 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1987  amino acid ABC transporter permease  62.99 
 
 
223 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45101  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0241  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.81 
 
 
222 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1927  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  46.36 
 
 
222 aa  191  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0357  amino acid ABC transporter permease  48.58 
 
 
222 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.76 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.7 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  46.48 
 
 
216 aa  189  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0243  amino acid ABC transporter permease  48.58 
 
 
221 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3699  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.78 
 
 
221 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1927  amino acid ABC transporter permease  43.32 
 
 
245 aa  185  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
226 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.31 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.571407  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7225  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  46.67 
 
 
219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1530  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.06 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692251  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1433  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4923  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.95 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4151  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2685  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.310396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3137  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.01 
 
 
226 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.490493  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1759  putative ABC transporter, permease protein  45.54 
 
 
228 aa  182  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00086145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.24 
 
 
503 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.64 
 
 
221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.57 
 
 
226 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.120537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2526  amino acid ABC transporter permease  46.57 
 
 
226 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 
503 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2004  amino acid ABC transporter, permease protein  44.06 
 
 
239 aa  180  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 
489 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 
489 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  44.44 
 
 
489 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2273  amino acid ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 
220 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2375  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
220 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617605  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0250  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.28 
 
 
222 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3139  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
226 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0639  amino acid ABC transporter, permease protein  45.07 
 
 
226 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.304387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>