More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4083 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  100 
 
 
235 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  100 
 
 
235 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  99.54 
 
 
218 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  96.79 
 
 
218 aa  417  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  86.38 
 
 
235 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  86.38 
 
 
235 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  86.38 
 
 
235 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  86.38 
 
 
235 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  86.38 
 
 
235 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  90.78 
 
 
218 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  90.78 
 
 
218 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2356  glutamine ABC transporter permease protein  88.89 
 
 
230 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3698  glutamine ABC transporter permease protein  65.9 
 
 
218 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1155  glutamine ABC transporter permease protein  62.67 
 
 
218 aa  279  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1707  glutamine ABC transporter permease protein  65.6 
 
 
228 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.165583  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  60.73 
 
 
219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  60.73 
 
 
219 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  60.27 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  59.82 
 
 
219 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  265  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1774  glutamine ABC transporter permease protein  62.39 
 
 
218 aa  254  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000313733  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1494  glutamine ABC transporter permease protein  62.39 
 
 
218 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0612957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1599  glutamine ABC transporter permease protein  62.39 
 
 
218 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1478  glutamine ABC transporter permease protein  60.73 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2489  glutamine ABC transporter permease protein  61.19 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1583  glutamine ABC transporter permease protein  57.99 
 
 
219 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.4 
 
 
227 aa  235  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2392  glutamine ABC transporter permease protein  55.25 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.88 
 
 
223 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  51.34 
 
 
251 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.83 
 
 
218 aa  208  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0354411 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.21 
 
 
223 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.96 
 
 
237 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.07 
 
 
226 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  46.95 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  42.79 
 
 
216 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 
235 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  38.03 
 
 
217 aa  158  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
233 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  40.19 
 
 
216 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  42.56 
 
 
501 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.04 
 
 
492 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
216 aa  151  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.59 
 
 
493 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.21 
 
 
216 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.49 
 
 
221 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0751  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  37.73 
 
 
545 aa  148  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0389728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.87 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538203  normal  0.259206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  37.44 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.71 
 
 
216 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
222 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.83 
 
 
513 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2596  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
271 aa  144  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000547103  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0684  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.34 
 
 
221 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0799785  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0136  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  35.41 
 
 
516 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000337877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 
230 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0214  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  35.51 
 
 
516 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.002492  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  36.1 
 
 
714 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0760  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
232 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.522965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0688  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
232 aa  141  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0861  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
263 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.820023 
 
 
-
 
NC_003296  RS00358  amino acid ABC transporter transmembrane protein  39.6 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0946  amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  39.13 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1870  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0086  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  34.43 
 
 
537 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0796672  normal  0.210719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0813  amino acid ABC transporter permease  34.98 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.803947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1036  amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0754  amino acid ABC transporter, permease  34.48 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0909  amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0948  amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0856  amino acid ABC transporter permease  34.98 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.926936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0352  amino acid ABC transproter, permease  34.93 
 
 
291 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0761  amino acid ABC transporter, permease  34.48 
 
 
226 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5743  putative amino acid ABC transporter permease  34.93 
 
 
269 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 
255 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4429  amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
209 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.21779  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0338  amino acid ABC transport system, permease  36.07 
 
 
269 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1655  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
213 aa  138  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0134455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  34.56 
 
 
502 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  34.56 
 
 
502 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.23 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.500436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2021  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.58 
 
 
337 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.871277  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 
223 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5480  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2509  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.07 
 
 
219 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>